Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTPDP35247 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms