Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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