Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC13P31276 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms