Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID4AP29374 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms