Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ABCD3P28288 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms