Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DNMT1P26358 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms