Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNE1P24864 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNE1P24864 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNE1P24864 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNE1P24864 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNE1P24864 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNE1P24864 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNE1P24864 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms