Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms