Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2B4P23634 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms