Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TNFSF4P23510 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFSF4P23510 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms