Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA6P23229 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms