Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD247P20963 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD247P20963 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD247P20963 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD247P20963 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD247P20963 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD247P20963 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD247P20963 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD247P20963 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms