Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP4AP20648 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP4AP20648 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms