Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PSMB1P20618 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PSMB1P20618 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms