Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC9A1P19634 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms