Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CREB1P16220 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CREB1P16220 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB1P16220 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB1P16220 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB1P16220 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB1P16220 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB1P16220 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB1P16220 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CREB1P16220 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CREB1P16220 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms