Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACADSP16219 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACADSP16219 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSP16219 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSP16219 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSP16219 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACADSP16219 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms