Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD44P16070 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD44P16070 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD44P16070 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD44P16070 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms