Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGA4P13612 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms