Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A1P11836 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A1P11836 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms