Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM225BP0DP42 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms