Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP10P09238 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MMP10P09238 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MMP10P09238 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MMP10P09238 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms