Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL2A1P02458 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL2A1P02458 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms