Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHG4P01861 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms