Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MBD3O95983 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD3O95983 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD3O95983 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MBD3O95983 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms