Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX7O95931 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX7O95931 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX7O95931 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX7O95931 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms