Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RAPGEF3O95398 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAPGEF3O95398 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms