Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KLHL18O94889 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLHL18O94889 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms