Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA10O75578 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA10O75578 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms