Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms