Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PITX3O75364 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX3O75364 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX3O75364 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX3O75364 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PITX3O75364 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PITX3O75364 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PITX3O75364 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms