Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ZNF253O75346 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ZNF253O75346 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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