Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45BO75293 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms