Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXA3O43365 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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