Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRTM2O43300 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRTM2O43300 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms