Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBDO15205 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBDO15205 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBDO15205 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UBDO15205 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
UBDO15205 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBDO15205 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBDO15205 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBDO15205 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBDO15205 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBDO15205 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBDO15205 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
UBDO15205 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms