Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1CO15160 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1CO15160 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms