Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD28O15084 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD28O15084 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms