Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNPHO15079 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SNPHO15079 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SNPHO15079 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SNPHO15079 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SNPHO15079 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNPHO15079 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNPHO15079 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNPHO15079 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNPHO15079 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNPHO15079 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SNPHO15079 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms