Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
ZNF561-AS1K7EIQ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms