Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QLI3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QLI3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
J3QLI3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
J3QLI3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
J3QLI3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
J3QLI3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
J3QLI3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms