Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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