Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L21D6R901 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms