Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L12C9JPN9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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