Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HHLA1C9JL84 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms