Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms