Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM4A7MD48 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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