Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RGPD3A6NKT7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RGPD3A6NKT7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms