Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC69A6NI79 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms