Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL33A6NCF5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms